RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 HGH1Q9BTY7 390 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PADI1Q9ULC6 663 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FLT1P17948 1338 aa4.9□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LNP1A1A4G5 178 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PROB1E7EW31 1015 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ANKRD28O15084 1053 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AVILO75366 819 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CSPG5O95196 566 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KCNK5O95279 499 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CLDN14O95500 239 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GH2P01242 217 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ALPLP05186 524 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF12P17014 697 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LIG4P49917 911 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HTR6P50406 440 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SUOXP51687 545 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 LTBQ06643 244 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CXCL9Q07325 125 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SPOCK1Q08629 439 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C9orf152Q5JTZ5 239 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 C18orf63Q68DL7 685 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CHST3Q7LGC8 479 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 GPR180Q86V85 440 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 METTL23Q86XA0 190 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF114Q8NC26 417 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 THAP6Q8TBB0 222 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TANKQ92844 425 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB9Q96C00 473 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 QRFPRQ96P65 431 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DNAJC18Q9H819 358 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF224Q9NZL3 707 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SIX4Q9UIU6 781 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CCL27Q9Y4X3 112 aa4.89□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ADAMDEC1O15204 470 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 INSIG1O15503 277 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KDM4BO94953 1096 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NTN1O95631 604 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CCDC175P0C221 793 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 HNF4AP41235 474 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PPP5CP53041 499 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TUBA1BP68363 451 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PDE1BQ01064 536 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 CAMK2DQ13557 499 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MVPQ14764 893 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 DLG2Q15700 870 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SYT16Q17RD7 645 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ERMARDQ5T6L9 678 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ADALQ6DHV7 355 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AACSQ86V21 672 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 EMC1Q8N766 993 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SLC38A9Q8NBW4 561 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 NEUROG1Q92886 237 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SNX21Q969T3 373 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ZNF479Q96JC4 524 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 ABHD1Q96SE0 405 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SEMA3CQ99985 751 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 RTN4RQ9BZR6 473 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 PADI3Q9ULW8 664 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 KNSTRNQ9Y448 316 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.88□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 EVPLQ92817 2033 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 A8MXE2 369 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 MID1O15344 667 aa4.87□□□□□ -1.63
CCL20-204ENST00000489160 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms