RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		K7EQM0	130 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		M0R082	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	AQP7	O14520	342 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BIRC5	O15392	142 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KCNQ3	O43525	872 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KLK8	O60259	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ATP2C2	O75185	946 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF202	O95125	648 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GSTM1	P09488	218 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CALCB	P10092	127 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DRD2	P14416	443 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	AREG	P15514	252 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NQO2	P16083	231 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ERCC2	P18074	760 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UCP1	P25874	307 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CD40LG	P29965	261 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CCND2	P30279	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HOXA9	P31269	272 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RORA	P35398	523 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CRAT	P43155	626 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KHK	P50053	298 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	HK2	P52789	917 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	STX1B	P61266	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PPP2R2B	Q00005	443 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TNK2	Q07912	1038 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MERTK	Q12866	999 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PDK2	Q15119	407 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NTRK2	Q16620	822 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LRRC24	Q50LG9	513 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TEX44	Q53QW1	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MLIP	Q5VWP3	458 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LIPN	Q5VXI9	398 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CST9LP1	Q5W188	147 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	STEAP3	Q658P3	488 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL35	Q6PF15	583 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZBTB2	Q8N680	514 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	C14orf79	Q96F83	325 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TOX2	Q96NM4	488 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF607	Q96SK3	696 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	CHID1	Q9BWS9	393 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	STOML1	Q9UBI4	398 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MSRA	Q9UJ68	235 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PLLP	Q9Y342	182 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	IFT52	Q9Y366	437 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A087WZY1	265 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0U1RQJ8	604 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	WIPF3	A6NGB9	483 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TTC3-214	ENST00000472398		H7C1D1	291 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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