RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX32Q86XE0 403 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCA1Q86XH1 822 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 THAP6Q8TBB0 222 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NXNL1Q96CM4 212 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZG16BQ96DA0 208 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A12Q96S37 553 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MGME1Q9BQP7 344 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf40Q9H1Z8 148 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PADI3Q9ULW8 664 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 POMT1Q9Y6A1 747 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0B4J293 547 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 J3QR06 171 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB43O43298 467 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TOMM70O94826 608 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNA5P22460 613 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CD38P28907 300 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPA4P34932 840 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF75DP51815 510 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CDK3Q00526 305 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SCN1BQ07699 218 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPB3Q12988 150 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2V1Q13404 147 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF273Q14593 569 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MELKQ14680 651 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ASIC2Q16515 512 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MFN1Q8IWA4 741 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 EXD1Q8NHP7 514 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GDAP1Q8TB36 358 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FNBP1Q96RU3 617 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A1W2PPM1 405 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SSX4O60224 188 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE7O76087 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE12FP0CL80 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE12GP0CL81 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE12IP0CL82 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXB2P14652 356 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 BMXP51813 675 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPZA1P52907 286 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CTSCP53634 463 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE1Q13065 139 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 GAGE4Q13068 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.681e-9■■□□□ 12
RABGGTB-207ENST00000470201 VWC2Q2TAL6 325 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 MPP7Q5T2T1 576 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 RGMBQ6NW40 437 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR73Q6P4I2 378 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ACVR1CQ8NER5 493 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 BBS10Q8TAM1 723 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 DENND1AQ8TEH3 1009 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ATL1Q8WXF7 558 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 ERO1AQ96HE7 468 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 OLFM1Q99784 485 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 EGFL8Q99944 293 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 DESI2Q9BSY9 194 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 NOX4Q9NPH5 578 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-207ENST00000470201 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms