RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC38	Q502W7	563 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SGF29	Q96ES7	293 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZMYND15	Q9H091	742 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PLD2	O14939	933 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TNFSF15	O95150	251 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	VCL	P18206	1134 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ITGAL	P20701	1170 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	IDS	P22304	550 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CSF2RB	P32927	897 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CFHR1	Q03591	330 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CDH17	Q12864	832 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	AMZ2	Q86W34	360 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC35F6	Q8N357	371 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAMTS20	P59510	1910 aa		28.8	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	LAMA5	O15230	3695 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN12	O43309	604 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SUN1	O94901	812 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	APRT	P07741	180 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PRSS56	P0CW18	603 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	BRAF	P15056	766 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	MPST	P25325	297 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SNX20	Q7Z614	316 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	NXPE1	Q8N323	547 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PRELID2	Q8N945	189 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	STYX	Q8WUJ0	223 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ULK4	Q96C45	1275 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	MS4A14	Q96JA4	679 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	THSD1	Q9NS62	852 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		28.79	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	AGAP14	A8MT82	685 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	MAPK9	P45984	424 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR10G6	Q8NH81	332 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		28.78	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A087WV48	116 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC19A1	P41440	591 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	GPLD1	P80108	840 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	NFE2L1	Q14494	772 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PISD	Q9UG56	409 aa		28.77	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	MROH6	A6NGR9	719 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089		H7C0S8	307 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	DUX1	O43812	170 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	GAS8	O95995	478 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	VIP	P01282	170 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	JMJD7	P0C870	316 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	ITIH1	P19827	911 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	ITPKB	P27987	946 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	ARSD	P51689	593 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	SQSTM1	Q13501	440 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	CLCA4	Q14CN2	919 aa		28.76	■■■□□ 2.19
FBXO18-208	ENST00000470089	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		28.76	■■■□□ 2.19

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