RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 IL2P60568 153 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ECT2LQ008S8 904 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RAD51Q06609 339 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MESP2Q0VG99 397 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RALGDSQ12967 914 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LCP2Q13094 533 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRAF3Q13114 568 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CEACAM7Q14002 265 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LRP8Q14114 963 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNA6Q15825 494 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CRY1Q16526 586 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GEN1Q17RS7 908 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 EML3Q32P44 896 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PIGGQ5H8A4 983 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP157Q5JU67 520 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ICE2Q659A1 982 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC6AQ6EIG7 209 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GRAMD4Q6IC98 578 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 XKR5Q6UX68 686 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 FAM151BQ6UXP7 276 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HACD2Q6Y1H2 254 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ACAD11Q709F0 780 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SYVN1Q86TM6 617 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SNX32Q86XE0 403 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CLYBLQ8N0X4 340 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP24Q8N264 748 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CHST14Q8NCH0 376 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ITFG1Q8TB96 612 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AGR3Q8TD06 166 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BHMTQ93088 406 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PHF21BQ96EK2 531 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 LINGO1Q96FE5 620 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SAMD11Q96NU1 681 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD27Q96NW4 1050 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPER2Q96P56 530 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF382Q96SR6 550 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BRD9Q9H8M2 597 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 RDH14Q9HBH5 336 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MRGBPQ9NV56 204 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 DKK3Q9UBP4 350 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUN2Q9UH99 717 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 CDH22Q9UJ99 828 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 APPL1Q9UKG1 709 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ERVW-1Q9UQF0 538 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 WNT6Q9Y6F9 365 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRC-210ENST00000462363 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SYCE1LA8MT33 242 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 IQCF5A8MTL0 148 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 BTN3A1O00481 513 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NEMP1O14524 444 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 OR7A17O14581 309 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ACOT8O14734 319 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 AZIN1O14977 448 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 PIP5K1BO14986 540 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 NUAK1O60285 661 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 XYLBO75191 536 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT7LO94864 414 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 MATN4O95460 622 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ANP32DO95626 131 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 TIMP2P16035 220 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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