RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPAN6O43657 245 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TM7SF2O76062 418 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TSPAN12O95859 305 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CPA3P15088 417 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 E2F5Q15329 346 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OR4D1Q15615 310 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ANO7Q6IWH7 933 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 HHIPQ96QV1 700 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM202A6NGA9 273 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TARM1B6A8C7 271 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC7O00311 574 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RAD51BO15315 384 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ACADMP11310 421 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TPMTP51580 245 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DMDP11532 3685 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 AP1G1O43747 822 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 COL6A2P12110 1019 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DRD4P21917 467 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ARRB2P32121 409 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CCR7P32248 378 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CCR10P46092 362 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CREB5Q02930 508 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC153Q494R4 210 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ULK4Q96C45 1275 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LINGO1Q96FE5 620 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SMOXQ9NWM0 555 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC31A1O15431 190 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MSH3P20585 1137 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OVGP1Q12889 678 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM219BQ5XKK7 198 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MACC1Q6ZN28 852 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 MSANTD3Q96H12 275 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OR2AG1Q9H205 316 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT16Q9UBV4 365 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DHRS7Q9Y394 339 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OR1A2Q9Y585 309 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 KANSL1LA0AUZ9 987 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ITM2AO43736 263 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DLX3O60479 287 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PYGLP06737 847 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 BST1Q10588 318 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 ITIH4Q14624 930 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CGB2Q6NT52 195 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKCQQ04759 706 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 INPP5AQ14642 412 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 DOK6Q6PKX4 331 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RLN3Q8WXF3 142 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM131CQ96AQ9 280 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 RAD18Q9NS91 495 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 STARD6P59095 220 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 IRF4Q15306 451 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 PNCKQ6P2M8 343 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-204ENST00000452765 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms