RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	MCF2L	O15068	1137 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	LIAS	O43766	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	OPN1MW	P04001	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TUBB4A	P04350	444 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RB1	P06400	928 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HEXA	P06865	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HEXB	P07686	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HOXB5	P09067	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	NR2F1	P10589	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM11	P17152	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CIITA	P33076	1130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	IFNAR2	P48551	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HSF1	Q00613	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TCP10	Q12799	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	COASY	Q13057	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GCKR	Q14397	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62	1e-7	■■■■■ 39.2
PUM2-208	ENST00000432105	KRT35	Q92764	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RITA1	Q96K30	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	PRRX2	Q99811	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	NUF2	Q9BZD4	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HTT	P42858	3142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105		A0A096LPK6	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105		A0A0G2JPF8	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CTAGE9	A4FU28	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	FAM157A	C9JC47	383 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TAF4	O00268	1085 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	IKBKB	O14920	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SCAMP1	O15126	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RIPK2	O43353	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	FMO6P	O60774	539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	KERA	O60938	352 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SEC22B	O75396	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GJB3	O75712	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	SLC25A12	O75746	678 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TMCC1	O94876	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	TF	P02787	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	QDPR	P09417	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	FOSL2	P15408	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CAPN2	P17655	700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CDA	P32320	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	PMPCA	Q10713	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	OLIG2	Q13516	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	NTRK2	Q16620	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM2-208	ENST00000432105	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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