RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PBKQ96KB5 322 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OSBPL9Q96SU4 736 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC38A3Q99624 504 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM9Q9P0T7 183 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WDR37Q9Y2I8 494 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa13.07□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC187A0A096LP49 1063 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 A0A0G2JNG1 304 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR52A4PA6NMU1 304 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF185O15231 689 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPNE6O95741 557 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GAS8O95995 478 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC2A4P14672 509 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VCLP18206 1134 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IDSP22304 550 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAPK9P45984 424 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VPS41P49754 854 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CFHR1Q03591 330 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NFE2L1Q14494 772 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIR2DS5Q14953 304 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TBC1D25Q3MII6 688 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AMZ2Q86W34 360 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RCBTB1Q8NDN9 531 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STYXQ8WUJ0 223 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ULK4Q96C45 1275 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GRAMD1AQ96CP6 724 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DCUN1D1Q96GG9 259 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF778Q96MU6 729 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM74Q96NL1 305 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STRADBQ9C0K7 418 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZMYND15Q9H091 742 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CASS4Q9NQ75 786 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HOMER3Q9NSC5 361 aa13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KNTC1P50748 2209 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AGAP14A8MT82 685 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLD2O14939 933 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZW10O43264 779 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SGTAO43765 313 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TNFSF15O95150 251 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCKBRP32239 447 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC19A1P41440 591 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CRADDP78560 199 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CLCA4Q14CN2 919 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SKIDA1Q1XH10 827 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SERPINA9Q86WD7 417 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIM48Q8IWZ4 208 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR10G6Q8NH81 332 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FGF11Q92914 225 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC74BQ96LY2 380 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 COPS8Q99627 209 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C19orf43Q9BQ61 176 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SNX12Q9UMY4 172 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 APC2O95996 2303 aa13.05□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HEATR9A2RTY3 570 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 OR5K4A6NMS3 321 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 H7C0S8 307 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DXOO77932 396 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 VIPP01282 170 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RALBP11234 206 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ITIH1P19827 911 aa13.04□□□□□ -0.32
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MSNP26038 577 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms