RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395833.7

LMO2-202, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 1,687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-202ENST00000395833 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 GANCQ8TET4 914 aa29.06■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 TMEM237Q96Q45 408 aa29.06■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PNPOQ9NVS9 261 aa29.06■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ATG2BQ96BY7 2078 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PP55 124 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ADAM23O75077 832 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CCR10P46092 362 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 COPAP53621 1224 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CCDC15Q0P6D6 951 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 FBRSQ9HAH7 460 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ABCF3Q9NUQ8 709 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 KCTD5Q9NXV2 234 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SYCE1LA8MT33 242 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 HGSO14964 777 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 INPP4BO15327 924 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 NPHS1O60500 1241 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CHRNGP07510 517 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 GFAPP14136 432 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 RAET1GQ6H3X3 334 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CCDC121Q6ZUS5 278 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MYO1HQ8N1T3 1032 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 KCNK13Q9HB14 408 aa29.05■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 F5P12259 2224 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 TSPAN6O43657 245 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 AP1G1O43747 822 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PCDH8O95206 1070 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 GPR1P46091 355 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 NFKB2Q00653 900 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ACSBG2Q5FVE4 666 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 KCNK4Q9NYG8 393 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SERGEFQ9UGK8 458 aa29.04■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 LRRK1Q38SD2 2015 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 AP2A2O94973 939 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 COL9A1P20849 921 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 AQP5P55064 265 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CREB5Q02930 508 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ZNF781Q8N8C0 355 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 LATS2Q9NRM7 1088 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 RAP2CQ9Y3L5 183 aa29.03■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CCDC189A1A4V9 331 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 GLULP15104 373 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MPSTP25325 297 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 TAS2R38P59533 333 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PFKFB4Q16877 469 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 GPSM1Q86YR5 675 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 FBXO39Q8N4B4 442 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 CNDP1Q96KN2 507 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SLC6A17Q9H1V8 727 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 DCTN3O75935 186 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 DNTTP04053 509 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MTHFD2P13995 350 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 IMPDH1P20839 514 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SERPINB5P36952 375 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 TMPRSS6Q8IU80 811 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 PELI3Q8N2H9 469 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 AGR3Q8TD06 166 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 FAM3CQ92520 227 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 MSANTD3Q96H12 275 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SIKE1Q9BRV8 207 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 FBXL12Q9NXK8 326 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 KLHL42Q9P2K6 505 aa29.02■■■□□ 2.24
LMO2-202ENST00000395833 A0A1W2PQF6 199 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 K7ESM1 405 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 CCR7P32248 378 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 PRKAA1Q13131 559 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SETDB1Q15047 1291 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 LEXMQ3ZCV2 418 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 FRA10AC1Q70Z53 315 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 LSMEM2Q8N112 164 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 L3HYPDHQ96EM0 354 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa29.01■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 IGLON5A6NGN9 336 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 QSOX1O00391 747 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 TM7SF2O76062 418 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SOD1P00441 154 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 SRFP11831 508 aa29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LMO2-202ENST00000395833 DPTQ07507 201 aa29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms