RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 Q75L30 129 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 KRT77Q7Z794 578 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 AFAP1Q8N556 730 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SLC5A8Q8N695 610 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TC2NQ8N9U0 490 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D16Q8TBP0 767 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PIGTQ969N2 578 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 LILRA5A6NI73 299 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PROB1E7EW31 1015 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 H0YIN7 160 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PLK4O00444 970 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SLC16A5O15375 505 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB43O43298 467 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF11O60813 436 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PMS2P2O95744 297 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 GGPS1O95749 300 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 MYOD1P15172 320 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 GJA1P17302 382 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CPT2P23786 658 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 HTR6P50406 440 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TUBA1BP68363 451 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 COG7P83436 770 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 RUNX1T1Q06455 604 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 DLG1Q12959 904 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 MELKQ14680 651 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PSMD6Q15008 389 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SNAPC1Q16533 368 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CBWD6Q4V339 395 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CBWD3Q5JTY5 395 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 KRT80Q6KB66 452 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CAMKMTQ7Z624 323 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 WDR20Q8TBZ3 569 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM19Q96HH6 336 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF479Q96JC4 524 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 NEK1Q96PY6 1258 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 GAREM1Q9H706 876 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 OLAHQ9NV23 265 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CCL27Q9Y4X3 112 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 OR2M5A3KFT3 312 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 OR5K3A6NET4 321 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 URADA6NGE7 173 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF587BE7ETH6 402 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM178BH3BS89 294 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 WISP2O76076 250 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 C22orf31O95567 290 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 ALPLP05186 524 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TSPY3P0CV98 308 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TSPY8P0CW00 308 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 MC5RP33032 325 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 USP8P40818 1118 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 PDLIM4P50479 330 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 CDH13P55290 713 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 TSPY1Q01534 308 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 LTBQ06643 244 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-205ENST00000391970 SLC20A2Q08357 652 aa3.03□□□□□ -1.92
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