RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF711Q9Y462 761 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRBC2A0A5B9 178 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR5K3A6NET4 321 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNHG28P0DPA3 235 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYOD1P15172 320 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ITGA2P17301 1181 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIG4P49917 911 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL11RAQ14626 422 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 RASA2Q15283 850 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KYNUQ16719 465 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ADALQ6DHV7 355 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 NADSYN1Q6IA69 706 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEP57Q86XR8 500 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CEP97Q8IW35 865 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC5A8Q8N695 610 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 POMGNT2Q8NAT1 580 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR10S1Q8NGN2 331 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR52I2Q8NH67 350 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC20A1Q8WUM9 679 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMC6Q96SB8 1091 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MEIS3Q99687 375 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CSTL1Q9H114 145 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 MMP27Q9H306 513 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 TAB2Q9NYJ8 693 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 HACL1Q9UJ83 578 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-190P-201ENST00000384154 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF541Q9H0D2 1346 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 A6NL46 340 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 C4orf47A7E2U8 309 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLK4O00444 970 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 DVL1O14640 695 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLGNO14967 610 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC16A5O15375 505 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 WISP2O76076 250 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM106CPP0CH98 169 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 T-ENOLP0DO92 83 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 NMBRP28336 390 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 TNFRSF8P28908 595 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 COG7P83436 770 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLIN5Q00G26 463 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDE1BQ01064 536 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 UBE2V1Q13404 147 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 FHL1Q13642 323 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 MELKQ14680 651 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 C9orf152Q5JTZ5 239 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM211Q6ICI0 200 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 TEX38Q6PEX7 206 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SATL1Q86VE3 508 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SFR1Q86XK3 245 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 AVL9Q8NBF6 648 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCTD6Q8NC69 237 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 KCNH5Q8NCM2 988 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 CCDC191Q8NCU4 936 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 MCUQ8NE86 351 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 BBS10Q8TAM1 723 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-190P-201ENST00000384154 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms