RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 MTMR10Q9NXD2 777 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 POLG2Q9UHN1 485 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ICAM5Q9UMF0 924 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHGB4Q9UN71 923 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
SNORD3E-201ENST00000362899 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LNP1A1A4G5 178 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR5K3A6NET4 321 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PRSS47A8MTI9 375 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFS4O43181 175 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNHIT1O43257 154 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 AHCYL1O43865 530 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TSPAN1O60635 241 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAMEF11O60813 436 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PDE9AO76083 593 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 BEST1O76090 585 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TPOP07202 933 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM106CPP0CH98 169 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CETPP11597 493 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MMP9P14780 707 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 AMD1P17707 334 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 DGKAP23743 735 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 AHRP35869 848 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LIG4P49917 911 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SIRPAP78324 504 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE2BQ13066 116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PLA2G7Q13093 441 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GTF2H2Q13888 395 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 IRF3Q14653 427 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC96Q2M329 555 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE2EQ4V326 116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF280DQ6N043 979 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBA1AQ71U36 451 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MAB21L3Q8N8X9 362 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PHF21AQ96BD5 680 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ABHD8Q96I13 439 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 EGLN2Q96KS0 407 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SLX1AQ9BQ83 275 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TUBA1CQ9BQE3 449 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 HGH1Q9BTY7 390 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MXD3Q9BW11 206 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 APOL6Q9BWW8 343 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SPATC1LQ9H0A9 340 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 IL25Q9H293 177 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 EBF2Q9HAK2 575 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR81Q562E7 1941 aa2.83□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM178BH3BS89 294 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 BUB3O43684 328 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 FMO5P49326 533 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 CLDN20P56880 219 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 COG7P83436 770 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE5Q13069 117 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GAGE6Q13070 117 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB17Q13105 803 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NR1D2Q14995 579 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ADALQ6DHV7 355 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 OR7E24Q6IFN5 339 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 PACS1Q6VY07 963 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ADGRA1Q86SQ6 560 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 LONP2Q86WA8 852 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NRROSQ86YC3 692 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 ODF3L1Q8IXM7 274 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 C1orf87Q8N0U7 546 aa2.82□□□□□ -1.96
SNORD3E-201ENST00000362899 NAGSQ8N159 534 aa2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms