RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 KIFC1Q9BW19 673 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ABCG4Q9H172 646 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TREX1Q9NSU2 369 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SOX13Q9UN79 622 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 RNF215Q9Y6U7 377 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.01□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FAM149AA5PLN7 773 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 A6NCN8 305 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PRR19A6NJB7 356 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SGTAO43765 313 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 POP7O75817 140 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 F3P13726 295 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 DBN1Q16643 649 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CASC4Q6P4E1 433 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CES3Q6UWW8 571 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PCGF5Q86SE9 256 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 AMZ2Q86W34 360 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 GALNT15Q8N3T1 639 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 OR4L1Q8NH43 312 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SLC37A2Q8TED4 501 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 HEXDCQ8WVB3 486 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF592Q92610 1267 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MFSD3Q96ES6 412 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SDR42E2A6NKP2 422 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CFAP99D6REC4 459 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 URI1O94763 535 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 VCLP18206 1134 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MAGEA3P43357 314 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 BCL7AQ4VC05 210 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 IYDQ6PHW0 289 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TMPRSS12Q86WS5 348 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SFRP1Q8N474 314 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SGSM3Q96HU1 749 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SAMD15Q9P1V8 674 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PPM1DO15297 605 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 KCNJ13O60928 360 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 JUPP14923 745 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PNLIPP16233 465 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PRLHRP49683 370 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 DMPKQ09013 629 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 BIRC2Q13490 618 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 NFE2L1Q14494 772 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SEMA3AQ14563 771 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 HOOK3Q86VS8 718 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CATSPERZQ9NTU4 200 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CDC23Q9UJX2 597 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.99□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MAGEB16A2A368 324 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MGAT4DA6NG13 374 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 VAPBO95292 243 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SLC2A4P14672 509 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 IDSP22304 550 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ARNTP27540 789 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 NSG1P42857 185 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 FASLGP48023 281 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CCL7P80098 99 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ITIH4Q14624 930 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 MORF4L2Q15014 288 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ARMC3Q5W041 872 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 PACS1Q6VY07 963 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.98□□□□□ -0.01
UBE3B-201ENST00000340074 SPRED1Q7Z699 444 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms