RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 MESP2Q0VG99 397 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TGFBIQ15582 683 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TRPC4APQ8TEL6 797 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 UGT3A2Q3SY77 523 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 MYO1HQ8N1T3 1032 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PELI3Q8N2H9 469 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF366Q8N895 744 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PPP6CO00743 305 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 XPAP23025 273 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 CRY1Q16526 586 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 KANK2Q63ZY3 851 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SBSNQ6UWP8 590 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 FRA10AC1Q70Z53 315 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 DPPA4Q7L190 304 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 AGAP11Q8TF27 550 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 HPS4Q9NQG7 708 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SMOXQ9NWM0 555 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 CD84Q9UIB8 345 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PCTPQ9UKL6 214 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PLXNA2O75051 1894 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 COL4A3Q01955 1670 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 C16orf96A6NNT2 1141 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 AZIN1O14977 448 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 AGTR2P50052 363 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 RAP1GDS1P52306 607 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 B4GALNT1Q00973 533 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 CHSY3Q70JA7 882 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 MAGEC3Q8TD91 643 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 DTX3LQ8TDB6 740 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PANX3Q96QZ0 392 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 RAD18Q9NS91 495 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 LOC100653049A0A140TA62 436 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 KRT34O76011 436 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 THRAP10827 490 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 RALGDSQ12967 914 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 HERC3Q15034 1050 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 CYHR1Q6ZMK1 362 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 FAM83DQ9H4H8 585 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 MRGBPQ9NV56 204 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXD8-201ENST00000313173 TM7SF2O76062 418 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO48Q5FWF7 155 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 TANGO2Q6ICL3 276 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 CHRDL2Q6WN34 429 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf60Q96EN9 201 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 MARK4Q96L34 752 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 RTKNQ9BST9 563 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB26Q9HCK0 441 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 ZFP14Q9HCL3 533 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 KCTD5Q9NXV2 234 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 CDH7Q9ULB5 785 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 MLYCDO95822 493 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R3AQ16821 1122 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 VITQ6UXI7 678 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 REV3LO60673 3130 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 RAD51BO15315 384 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 PRNPP04156 253 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 MMP12P39900 470 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A3Q00325 362 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 CUL3Q13618 768 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD54Q6NXT1 300 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 SYCE2Q6PIF2 218 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 TWIST2Q8WVJ9 160 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 THTPAQ9BU02 230 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 ABCG8Q9H221 673 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 OARD1Q9Y530 152 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXD8-201ENST00000313173 S100BP04271 92 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms