RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LMO7DNF2Z398 122 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 YY2O15391 372 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ALPPL2P10696 532 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 TTPAP49638 278 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LRP8Q14114 963 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 INSCQ1MX18 579 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK6Q9Y257 313 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 OR1I1O60431 355 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR1BP42025 376 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NSG1P42857 185 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR1AP61163 376 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CBLBQ13191 982 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF470Q6ECI4 717 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 KCNMB4Q86W47 210 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NRROSQ86YC3 692 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PALM2Q8IXS6 379 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GPR34Q9UPC5 381 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 SLC30A4O14863 429 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFS3O75489 264 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 GIMD1P0DJR0 217 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 ERVK-10P10266 1014 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CUL1Q13616 776 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 STEAP4Q687X5 459 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PACS1Q6VY07 963 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 GPR150Q8NGU9 434 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 OR4C6Q8NH72 309 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CERS2Q96G23 380 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PLAC1Q9HBJ0 212 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 KLC4Q9NSK0 619 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM38O00635 465 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TPP1O14773 563 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PFDN6O15212 129 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 SIGLEC6O43699 453 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 SGTAO43765 313 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 POP7O75817 140 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 OGNP20774 298 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CILP2Q8IUL8 1156 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CALML6Q8TD86 181 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 C9orf72Q96LT7 481 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 FMO2Q99518 471 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TIMM29Q9BSF4 260 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 FAM167BQ9BTA0 163 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 DPEP2Q9H4A9 486 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TAAR2Q9P1P5 351 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 ECHS1P30084 290 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 MAGEA4P43358 317 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 PRLHRP49683 370 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 CTBP1Q13363 440 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 BCL7AQ4VC05 210 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 AMZ2Q86W34 360 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 LMNTD2Q8IXW0 634 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 GSDMBQ8TAX9 411 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 TCF12Q99081 682 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 NFU1Q9UMS0 254 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 B4DGG1 531 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 AP2A2O94973 939 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD4-201ENST00000306324 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms