RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 LRRC20Q8TCA0 184 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 A0A1W2PQ72 361 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 YJEFN3A6XGL0 299 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 YAP1P46937 504 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 LBX2Q6XYB7 198 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MINDY2Q8NBR6 621 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 FZD8Q9H461 694 aa18.51■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 A0A1W2PQH9 124 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 KPNA6O60684 536 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PGK1P00558 417 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 RPN2P04844 631 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 AKR1A1P14550 325 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 FCGRTP55899 365 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 GNA12Q03113 381 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PLD1Q13393 1074 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 C9orf131Q5VYM1 1079 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 COPS4Q9BT78 406 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 EXD2Q9NVH0 621 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 FAM172BPA6NC97 362 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TSPAN4O14817 238 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TIE1P35590 1138 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MBLAC2Q68D91 279 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 USP45Q70EL2 814 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 FAM220AQ7Z4H9 259 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TAC4Q86UU9 113 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ASB9Q96DX5 294 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MIPEPQ99797 713 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SPEF1Q9Y4P9 236 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PTPRJQ12913 1337 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 URODP06132 367 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OR4Q2P0C623 313 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TNNI3P19429 210 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 HNF4AP41235 474 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 KIR3DL1P43629 444 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OMPP47874 163 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 BIKQ13323 160 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ACOX1Q15067 660 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 GLUD2P49448 558 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 IST1P53990 364 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OLFML2AQ68BL7 652 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 HERPUD2Q9BSE4 406 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PSAT1Q9Y617 370 aa18.5■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 IRGMA1A4Y4 181 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 E9PAM4 449 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SCELO95171 688 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SNX4O95219 450 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 RLN1P04808 185 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PRKCHP24723 683 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 BHLHB9Q6PI77 547 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF607Q96SK3 696 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 HOXA2O43364 376 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PIGRP01833 764 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 GPAT3Q53EU6 434 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 C6orf183Q5T699 404 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SVOPLQ8N434 492 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PPTC7Q8NI37 304 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SIGLEC10Q96LC7 697 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MATN3O15232 486 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OR4F21O95013 312 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 CCR4P51679 360 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PCLAFQ15004 111 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 MON1AQ86VX9 555 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 OAZ3Q9UMX2 235 aa18.49■□□□□ 0.55
PRKCI-201ENST00000295797 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms