RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 EGFP01133 1207 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 IMPDH1P20839 514 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CORO7P57737 925 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TAS2R38P59533 333 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CREB5Q02930 508 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ACSBG2Q5FVE4 666 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DET1Q7L5Y6 550 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MAPK15Q8TD08 544 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AP2M1Q96CW1 435 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ERP27Q96DN0 273 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPV5Q9NQA5 729 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SHISA7A6NL88 538 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 K7ESM1 405 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MID1O15344 667 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP20O60882 483 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM23O75077 832 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 C6P13671 934 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CCR7P32248 378 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ELP6Q0PNE2 266 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PON2Q15165 354 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PFKFB4Q16877 469 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC50Q53HI1 259 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CNDP1Q96KN2 507 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF112Q9ULX5 631 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 F8W8V4 182 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KLK8O60259 260 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 KIAA0754O94854 1291 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TPBGLP0DKB5 382 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 COPAP53621 1224 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 HERVK_113P63132 956 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CST6Q15828 149 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 AGBL4Q5VU57 503 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SBSNQ6UWP8 590 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB2Q8N680 514 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 VPS35Q96QK1 796 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD18Q9NS91 495 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 NUMA1Q14980 2115 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 MATN2O00339 956 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DCTN3O75935 186 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ASGR2P07307 311 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 IDH3AP50213 366 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 ASPHQ12797 758 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 BNIP1Q12981 228 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CLNKQ7Z7G1 428 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GLYATL1Q969I3 302 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 GABRG3Q99928 467 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 COG4Q9H9E3 785 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 CD248Q9HCU0 757 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 DYRK4Q9NR20 520 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 COL6A3P12111 3177 aa9.21□□□□□ -0.93
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQF6 199 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM233B4DJY2 109 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP6CO00743 305 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 NPC1O15118 1278 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 GRID2O43424 1007 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKAA1Q13131 559 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms