RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SPG21Q9NZD8 308 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 EXTL2Q9UBQ6 330 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FAM205AQ6ZU69 1335 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CLDN4O14493 209 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 MOCS3O95396 460 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ITGB8P26012 769 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 DCTDP32321 178 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 HNMTP50135 292 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GAD2Q05329 585 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ITGADQ13349 1161 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ARHGEF6Q15052 776 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 NOTUMQ6P988 496 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CCDC83Q8IWF9 413 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 OR1J2Q8NGS2 313 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 HM13Q8TCT9 377 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TMEM186Q96B77 213 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SPATA33Q96N06 139 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GFI1Q99684 422 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TMEM79Q9BSE2 394 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.93□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 A0A1W2PPQ1 181 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 PIPSLA2A3N6 862 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TMEM221A6NGB7 291 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 H7C1Q1 480 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 RGS11O94810 467 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TGFAP01135 160 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 RAB40ALP0C0E4 278 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ACRV1P26436 265 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CHATP28329 748 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ADSSP30520 456 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GABRA5P31644 462 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CNR2P34972 360 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SERPINB6P35237 376 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GRIA3P42263 894 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CCT8P50990 548 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FAM27E3Q08E93 113 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SGCGQ13326 291 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TRIM29Q14134 588 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 NEK5Q6P3R8 708 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ZNF410Q86VK4 478 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ATL1Q8WXF7 558 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 KAT2BQ92831 832 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 RIT1Q92963 219 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SPDL1Q96EA4 605 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CCDC17Q96LX7 622 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FEVQ99581 238 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 TXN2Q99757 166 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CPNE1Q99829 537 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 PKP2Q99959 881 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ISCUQ9H1K1 167 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GPR108Q9NPR9 543 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FBXL5Q9UKA1 691 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ZNF536O15090 1300 aa5.92□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A23A1A5C7 686 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 HEPACAM2A8MVW5 462 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 M0QZ24 198 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 FCGR3BO75015 233 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 GCATO75600 419 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 CLDN7O95471 211 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 LCKP06239 509 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 KRT13P13646 458 aa5.91□□□□□ -1.46
MDM2-201ENST00000258148 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms