RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237014.7

TTR-201, Transcript of transthyretin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTR, Length 957 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-201ENST00000237014 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PARP6Q2NL67 630 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 P3H1Q32P28 736 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 XKR5Q6UX68 686 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SFRP1Q8N474 314 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TRIM58Q8NG06 486 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 NAT14Q8WUY8 206 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PDLIM2Q96JY6 352 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ABCG4Q9H172 646 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RMI1Q9H9A7 625 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RAD18Q9NS91 495 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SMOXQ9NWM0 555 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RAXQ9Y2V3 346 aa7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 USP27XA6NNY8 438 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 AGAP14A8MT82 685 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SGTAO43765 313 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRAMEF1O95521 474 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 IFNB1P01574 187 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FGGP02679 453 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRSS56P0CW18 603 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 BRAFP15056 766 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PNLIPP16233 465 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 TPH1P17752 444 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GRIA1P42261 906 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 MAP2K3P46734 347 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FASLGP48023 281 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OR1D5P58170 312 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GABREP78334 506 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CFHR1Q03591 330 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PEX6Q13608 980 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SPIDRQ14159 915 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRPSAP1Q14558 356 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRELID2Q8N945 189 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 OR6C4Q8NGE1 309 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 RDH14Q9HBH5 336 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 SATB2Q9UPW6 733 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PKP3Q9Y446 797 aa7.19□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CCDC78A2IDD5 438 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 GPR89AB7ZAQ6 455 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 VEGFDO43915 354 aa7.18□□□□□ -1.26
TTR-201ENST00000237014 CEP104O60308 925 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms