RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acap1Q8K2H4 740 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbmx2Q8R0F5 326 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr183Q8VFB9 309 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itfg1Q99KW9 610 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Armc1Q9D7A8 282 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gid8Q9D7M1 228 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IcmtQ9EQK7 283 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa20.84■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1200A2ATJ4 336 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan4bE9Q3G0 505 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MntO08789 591 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PbsnO08976 174 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stc1O55183 247 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Etv2P41163 335 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sephs2P97364 452 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp560Q3URI6 754 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FicdQ8BIX9 458 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vrk2Q8BN21 503 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spp2Q8K1I3 203 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1353Q8VGU8 309 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr570Q8VH12 312 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usb1Q91W78 267 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syt12Q920N7 421 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cers2Q924Z4 380 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcam1Q99NB3 548 aa20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 KlO35082 1014 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 E2f3O35261 457 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01679 107 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aff3P51827 1254 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr4P97288 388 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RalgdsQ03385 852 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc45a4Q0P5V9 785 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc58Q3UGP9 366 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss36Q5K2P8 849 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A4galtQ67BJ4 359 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tshz2Q68FE9 1030 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcas1Q80YN3 633 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cept1Q8BGS7 416 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ostm1Q8BGT0 338 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ftsj1Q8CBC7 324 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Creb5Q8K1L0 357 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Taf12Q8VE65 161 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Oas1cQ924S2 362 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrpl1Q99N96 336 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nectin1Q9JKF6 515 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sgk2Q9QZS5 367 aa20.83■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col4a6B1AVK5 1691 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4921501E09RikA0A0R4J054 908 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gbp11A9YVJ5 442 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mllt10O54826 1068 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf143O70230 638 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btg4O70552 250 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01636 108 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Traf2P39429 501 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vps26aP40336 327 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CartptP56388 129 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inpp5jP59644 1003 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AnpepP97449 966 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q3U4G0 281 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Syce1lQ5D525 247 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlipQ5FW52 269 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem255bQ5FW56 369 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Flot2Q60634 428 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Actr3bQ641P0 418 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 N4bp1Q6A037 893 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lair1Q8BG84 263 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp595Q8BIN6 625 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FgbQ8K0E8 481 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt4Q8R2U6 179 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd2dQ91VV4 469 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ska2Q9CR46 120 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc28a3Q9ERH8 703 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtsmQ9JL96 333 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ralgps1A2AR50 585 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GzmkO35205 263 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 JundP15066 341 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr3P35413 330 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 WasP70315 520 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ptchd3Q0EEE2 906 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pacs2Q3V3Q7 862 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcna5Q61762 602 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr295Q7TS08 309 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akr1c13Q8VC28 323 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ak5Q920P5 562 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RhoaQ9QUI0 193 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pkp3Q9QY23 797 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nrf1Q9WU00 503 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TertO70372 1122 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scg5P12961 212 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hspa4lP48722 838 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 OxtrP97926 388 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxk2Q3UCQ1 651 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hesx1Q61658 185 aa20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 XpaQ64267 272 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 67 ms