RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640094.1

HLA-B-257, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

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Gene HLA-B, Length 147 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-257ENST00000640094 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 VPS16Q9H269 839 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FGF21Q9NSA1 209 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KLC4Q9NSK0 619 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 A6NL46 340 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 C9J4A7 227 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 H3BRJ5 948 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 VEGFDO43915 354 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PRPSAP2O60256 369 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 JCHAINP01591 159 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 IGHEP01854 428 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 EBLN1P0CF75 366 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SOX5P35711 763 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ARL4AP40617 200 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 HALP42357 657 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MAXP61244 160 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PTSQ03393 145 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GPR18Q14330 331 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PLCL1Q15111 1095 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MIIPQ5JXC2 388 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MARC1Q5VT66 337 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TMCO3Q6UWJ1 677 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CARFQ8N187 725 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 COG1Q8WTW3 980 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PIH1D2Q8WWB5 315 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 AGAP2Q99490 1192 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 NLNQ9BYT8 704 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TCFL5Q9UL49 500 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PDZD2O15018 2839 aa8.48□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 POLEQ07864 2286 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KMOO15229 486 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FZD6O60353 706 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RNF8O76064 485 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ATP1A3P13637 1013 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FOLR1P15328 257 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CHRNB2P17787 502 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PSMA2P25787 234 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 SLC19A1P41440 591 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 HCAR3P49019 387 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 HSD11B2P80365 405 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 GPS2Q13227 327 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RAPSNQ13702 412 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ATP1A4Q13733 1029 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DPYSQ14117 519 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KCNAB1Q14722 419 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TMTC4Q5T4D3 741 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 PGBD5Q8N414 524 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZADH2Q8N4Q0 377 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 LYSMD1Q96S90 227 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 OR2AG1Q9H205 316 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 CHST8Q9H2A9 424 aa8.47□□□□□ -1.05
HLA-B-257ENST00000640094 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.47□□□□□ -1.05
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