RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 PPP2R2BQ00005 443 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SNAPC1Q16533 368 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPR135Q8IZ08 494 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF10O60809 474 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TCEA3O75764 348 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRBC1P01850 177 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MGAT1P26572 445 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PFKFB4Q16877 469 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 YME1L1Q96TA2 773 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR2AG2A6NM03 316 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CRISP1P54107 249 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 XKR6Q5GH73 641 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SV2AQ7L0J3 742 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC34A3Q8N130 599 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 STUB1Q9UNE7 303 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ATRNO75882 1429 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 F5H423 210 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PDPK1O15530 556 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LIASO43766 372 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TSPAN1O60635 241 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GJB6O95452 261 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IGKV5-2P06315 115 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IRF1P10914 325 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PSKH1P11801 424 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GRK5P34947 590 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 INHBEP58166 350 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GRB10Q13322 594 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SNTA1Q13424 505 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAPK14Q16539 360 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PROSER3Q2NL68 480 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ACOT1Q86TX2 421 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SPOCK2Q92563 424 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC5A5Q92911 643 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TLR10Q9BXR5 811 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C1orf109Q9NX04 203 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 COG5Q9UP83 839 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FPGTO14772 594 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RCBTB2O95199 551 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 H6PDO95479 791 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CACNG1Q06432 222 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 XKR4Q5GH76 650 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FBXO30Q8TB52 745 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UBA3Q8TBC4 463 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DPF2Q92785 391 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MARK4Q96L34 752 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LRRTM2O43300 516 aa6.31□□□□□ -1.4
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