RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621160.4

IFI27-215, Transcript of interferon alpha inducible protein 27, human

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFI27, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFI27-215	ENST00000621160	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CCR10	P46092	362 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TRIM14	Q14142	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PMPCB	O75439	489 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	UBXN7	O94888	489 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CDK14	O94921	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TYRP1	P17643	537 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PTPN3	P26045	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	STAT5A	P42229	794 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	DYNLT1	P63172	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CDC20	Q12834	499 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PRKAR1A	P10644	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	AMD1	P17707	334 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	IDS	P22304	550 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	HMGCL	P35914	325 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CDKN2B	P42772	138 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	SLC1A1	P43005	524 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	NR2C2	P49116	596 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	MAP7	Q14244	749 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TAZ	Q16635	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ESX1	Q8N693	406 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	STARD8	Q92502	1023 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	POT1	Q9NUX5	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	PTPN13	Q12923	2485 aa		13.71	□□□□□ -0.21
IFI27-215	ENST00000621160	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.71	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	MAST4	O15021	2626 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	MFAP3L	O75121	409 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	TNNT1	P13805	278 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	ZNF28	P17035	718 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	COMT	P21964	271 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	F8A1	P23610	371 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	SEPHS1	P49903	392 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	SH3BP2	P78314	561 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	MC1R	Q01726	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	TLE1	Q04724	770 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	FOXM1	Q08050	763 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	GPR18	Q14330	331 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.7	□□□□□ -0.22
IFI27-215	ENST00000621160	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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