RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 BIRC7Q96CA5 298 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 HEPHQ9BQS7 1158 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 EDEM2Q9BV94 578 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 LNP1A1A4G5 178 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PLK4O00444 970 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PRAMEF11O60813 436 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM13O60858 407 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINF2P08697 491 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 KITP10721 976 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TUBB3Q13509 450 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ITGA9Q13797 1035 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 FAM13CQ8NE31 585 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.38■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 LEFTY1O75610 366 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CTSLP07711 333 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 DRD3P35462 400 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CD86P42081 329 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CHRNA4P43681 627 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ABCG1P45844 678 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CD151P48509 253 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 RAB10P61026 200 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CNTN1Q12860 1018 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 NEPROQ6NW34 567 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 MIPEPQ99797 713 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC106Q9BWC9 280 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 OXSMQ9NWU1 459 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1B0GTW7 788 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 MROH6A6NGR9 719 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 A8MUI8 341 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SLC1A2P43004 574 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ADPRHP54922 357 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 POU4F1Q01851 419 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.014e-6■■□□□ 12.3
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC14A2Q15849 920 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 WLSQ5T9L3 541 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 STPG1Q5TH74 334 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.37■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.37■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 STYXQ8WUJ0 223 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PEX13Q92968 403 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PDFQ9HBH1 243 aa21.37■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 ACOT9Q9Y305 439 aa21.37■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CHD5Q8TDI0 1954 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PI4KAP42356 2102 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TARM1B6A8C7 271 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF195O14628 629 aa21.36■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC7A4O43246 635 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TMCC1O94876 653 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 EPOP01588 193 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 STMN1P16949 149 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ENGP17813 658 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ARRB2P32121 409 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 GMPRP36959 345 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 HK2P52789 917 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 RHOAP61586 193 aa21.36■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 RAD51Q06609 339 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CTBP1Q13363 440 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 LAMB3Q13751 1172 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PCSK7Q16549 785 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ATG14Q6ZNE5 492 aa21.36■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 PLPP6Q8IY26 295 aa21.36■■□□□ 1.01
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