RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TGM7Q96PF1 710 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM29Q9BSF4 260 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 GPR63Q9BZJ6 419 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF711Q9Y462 761 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC4A1P02730 911 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 BRAFP15056 766 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 BPIP17213 487 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 AMD1P17707 334 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CDK18Q07002 472 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 LRRD1A4D1F6 860 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PDZK1P1A8MUH7 402 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 VEGFDO43915 354 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CASP14P31944 242 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SEPHS1P49903 392 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SH3BP2P78314 561 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT6Q14141 434 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 IL11RAQ14626 422 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PDK1Q15118 436 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC14A2Q15849 920 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 IGFBP7Q16270 282 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PCSK7Q16549 785 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC18A3Q16572 532 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 VSIG1Q86XK7 387 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 OLFM3Q96PB7 478 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 OR6C1Q96RD1 312 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 POT1Q9NUX5 634 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD3Q9Y597 815 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 MTX2O75431 263 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CDK14O94921 469 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RPL10P27635 214 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 DLSTP36957 453 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 MESDQ14696 234 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP9Q5VTM2 703 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 WASH2PQ6VEQ5 465 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS42Q7Z5A4 293 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RNF31Q96EP0 1072 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 WASH6PQ9NQA3 447 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CROTQ9UKG9 612 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KCNMB2Q9Y691 235 aa24.51■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 APOL1O14791 398 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 NDST3O95803 873 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CAPZBP47756 277 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
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PTPRF-216ENST00000617451 NPNTQ6UXI9 565 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL6Q8WZ60 621 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RSC1A1Q92681 617 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 VPS35Q96QK1 796 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SPO11Q9Y5K1 396 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 OR52A4PA6NMU1 304 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 AURKAO14965 403 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RASSF9O75901 435 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFA10O95299 355 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM253P0C7T8 217 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 FGF5P12034 268 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 IDSP22304 550 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 DRG2P55039 364 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 GPR18Q14330 331 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 C11orf96Q7Z7L8 435 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 RASGRP3Q8IV61 690 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 GLOD4Q9HC38 313 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 IFNKQ9P0W0 207 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ANKMY1Q9P2S6 941 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 EPHA6Q9UF33 1036 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SYCE3A1L190 88 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0754O94854 1291 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CACHD1Q5VU97 1274 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.48■■□□□ 1.51
PTPRF-216ENST00000617451 CXorf40BQ96DE9 158 aa24.48■■□□□ 1.51
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