RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PIK3CG	P48736	1102 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	ACADVL	P49748	655 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PLD1	Q13393	1074 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	CBR4	Q8N4T8	237 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	STON2	Q8WXE9	905 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	FATE1	Q969F0	183 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	LRRC58	Q96CX6	371 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	DERL2	Q9GZP9	239 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	SARDH	Q9UL12	918 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	VWA8	A3KMH1	1905 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	LCHN	A4D1U4	455 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	BNIP3L	O60238	219 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	AOC2	O75106	756 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	FGF4	P08620	206 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	HK3	P52790	923 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	CDH4	P55283	916 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	KCNK10	P57789	538 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TRAF2	Q12933	501 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	AAK1	Q2M2I8	961 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	HECTD3	Q5T447	861 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	SEPHS2	Q99611	448 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	GMEB1	Q9Y692	573 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		12.78	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	DHRS12	A0PJE2	317 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341		K7ERQ8	282 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	FXYD1	O00168	92 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	CYBB	P04839	570 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	SLC6A2	P23975	617 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	GK	P32189	559 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	IL2	P60568	153 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TMED1	Q13445	227 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	OR2T11	Q8NH01	316 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	RAET1E	Q8TD07	263 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	CCT7	Q99832	543 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	ABCG8	Q9H221	673 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		12.77	□□□□□ -0.36
SMTN-222	ENST00000612341	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341		H0Y626	953 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341		H3BNC9	293 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341		H3BSA7	217 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	STC2	O76061	302 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	GNAO1	P09471	354 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	HSPA13	P48723	471 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SUOX	P51687	545 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SP3	Q02447	781 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	TCTN1	Q2MV58	587 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	FAM47B	Q8NA70	645 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	ROPN1L	Q96C74	230 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	MRGBP	Q9NV56	204 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	VILL	O15195	856 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	KDELR3	O43731	214 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CHEK2	O96017	543 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CCL23	P55773	120 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	AHI1	Q8N157	1196 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	ABHD8	Q96I13	439 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	ASB2	Q96Q27	587 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		12.77	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.76	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
SMTN-222	ENST00000612341	CLDN11	O75508	207 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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