RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587260.1

NFIX-208, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-208ENST00000587260 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.76□□□□□ -0.05
NFIX-208ENST00000587260 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.76□□□□□ -0.05
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NFIX-208ENST00000587260 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.76□□□□□ -0.05
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NFIX-208ENST00000587260 GPATCH11Q8N954 259 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-208ENST00000587260 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.74□□□□□ -0.05
NFIX-208ENST00000587260 HIC2Q96JB3 615 aa14.74□□□□□ -0.05
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