RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEB16	A2A368	324 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229		B4DGG1	531 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	LMO7DN	F2Z398	122 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	VAPB	O95292	243 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GPR89B	P0CG08	455 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ACTR1B	P42025	376 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ACTR1A	P61163	376 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DAB2	P98082	770 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CTBS	Q01459	385 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GUCY2D	Q02846	1103 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	MSS51	Q4VC12	460 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	OR4C6	Q8NH72	309 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	KCNK6	Q9Y257	313 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CEP250	Q9BV73	2442 aa		24.62	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM38	O00635	465 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	KMO	O15229	486 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	YY2	O15391	372 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SIGLEC6	O43699	453 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PSMA3	P25788	255 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DBN1	Q16643	649 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PIP4P1	Q86T03	277 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP36	Q96G28	342 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GPR34	Q9UPC5	381 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	24.61	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP54	Q96N23	3096 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	POLB	P06746	335 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PGAM1	P18669	254 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ID4	P47928	161 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PLTP	P55058	493 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC157	Q569K6	752 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ARMC3	Q5W041	872 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SGF29	Q96ES7	293 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CDC6	Q99741	560 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	BOC	Q9BWV1	1114 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	KLC4	Q9NSK0	619 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GULP1	Q9UBP9	304 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		24.6	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	AGAP14	A8MT82	685 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CHUK	O15111	745 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PML	P29590	882 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ELK3	P41970	407 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CTSC	P53634	463 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	LRP8	Q14114	963 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CENPU	Q71F23	418 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GLMN	Q92990	594 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		24.59	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TPP1	O14773	563 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SNX2	O60749	519 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	USP1	O94782	785 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	GIMD1	P0DJR0	217 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	MYF5	P13349	255 aa		24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	24.58	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	VCL	P18206	1134 aa		24.58	■■□□□ 1.53

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