RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	DDC	P20711	480 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HSD3B2	P26439	372 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ITPKB	P27987	946 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SERPINB3	P29508	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HADHA	P40939	763 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FOLR3	P41439	243 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ELK3	P41970	407 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PSMC4	P43686	418 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	HSPA13	P48723	471 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NR2C2	P49116	596 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC26A2	P50443	739 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PRKAA2	P54646	552 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ASPH	Q12797	758 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RCN1	Q15293	331 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	STXBP2	Q15833	593 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KAZN	Q674X7	775 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NCSTN	Q92542	709 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CDKL2	Q92772	493 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GBP5	Q96PP8	586 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CNPY3	Q9BT09	278 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341		Q9H521	79 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ASB7	Q9H672	318 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF302	Q9NR11	478 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	MDM4	O15151	490 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	YY2	O15391	372 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	PRPSAP2	O60256	369 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CFDP1-208	ENST00000569341	GLRA3	O75311	464 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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