RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 RASA4BC9J798 803 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 RASA4O43374 803 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 B4GAT1O43505 415 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CCNB1P14635 433 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 GLB1P16278 677 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 HTR1BP28222 390 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 MAGEA4P43358 317 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 LIG3P49916 1009 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 B4GALNT1Q00973 533 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TEX44Q53QW1 395 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SPRED1Q7Z699 444 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PCGF5Q86SE9 256 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM46DQ8NEK8 389 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CCL4L1Q8NHW4 92 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 EXOC2Q96KP1 924 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 FGF22Q9HCT0 170 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 RIPK2O43353 540 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PIAS1O75925 651 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SFTPCP11686 197 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CCL4P13236 92 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 HTR7P34969 479 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SUOXP51687 545 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ELP6Q0PNE2 266 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SLMAPQ14BN4 828 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 AGERQ15109 404 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 UGP2Q16851 508 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 BBS9Q3SYG4 887 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ALS2CLQ60I27 953 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TAF8Q7Z7C8 310 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 LZTR1Q8N653 840 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM159Q96B96 161 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ARL8AQ96BM9 186 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC12A9Q9BXP2 914 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 E7EVH7 732 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PEX11BO96011 259 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PNLIPP16233 465 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CCNCP24863 283 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 MMP12P39900 470 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ARSDP51689 593 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TLE1Q04724 770 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC10A7Q0GE19 358 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SERINC3Q13530 473 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 HIF1AQ16665 826 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PHF19Q5T6S3 580 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CMKLR1Q99788 373 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 SMIM23A6NLE4 172 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 B4DGG1 531 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 MATN3O15232 486 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 TTC4O95801 387 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 GM2AP17900 193 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 NFKB1P19838 968 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 LMAN1P49257 510 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 NDST2P52849 883 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 GYS2P54840 703 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 OR1D5P58170 312 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 KIAA1024LP59773 190 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF844Q08AG5 666 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ARHGEF7Q14155 803 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PARP6Q2NL67 630 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF534Q76KX8 674 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 KDELC2Q7Z4H8 507 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 HOOK3Q86VS8 718 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
RABGGTA-204ENST00000558376 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms