RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 UFM1P61960 85 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TUBB3Q13509 450 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR2T3Q8NH03 318 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PRR23AA6NEV1 266 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 LDB2O43679 373 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 EPB42P16452 691 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ARHGDIAP52565 204 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PGBD5Q8N414 524 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GANCQ8TET4 914 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 C3orf30Q96M34 536 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CLDN7O95471 211 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CLIC3O95833 236 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ITPKAP23677 461 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ANKRD46Q86W74 232 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FAM192AQ9GZU8 254 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 YIPF1Q9Y548 306 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 EVPLLA8MZ36 301 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PTGES3LE9PB15 166 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KRT6AP02538 564 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KRT6BP04259 564 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NTRK1P04629 796 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SLC6A4P31645 630 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KRT6CP48668 564 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TLE2Q04725 743 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ITIH5Q86UX2 942 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FIBCD1Q8N539 461 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PSKH2Q96QS6 385 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 INVSQ9Y283 1065 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CEP290O15078 2479 aa14.7□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NBNO60934 754 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CDH15P55291 814 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ALG2Q9H553 416 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 A0A1W2PRU2 124 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MAGEA11P43364 429 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GPR141Q7Z602 305 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ASB9Q96DX5 294 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NRBF2Q96F24 287 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TCF12Q99081 682 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KIF17Q9P2E2 1029 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MYO1DO94832 1006 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SERPIND1P05546 499 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ACRP10323 421 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ADRA1AP35348 466 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ST8SIA6P61647 398 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ABRQ12979 859 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TLR1Q15399 786 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 RBFAQ8N0V3 343 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 COPS8Q99627 209 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.69□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 VPS4BO75351 444 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OTCP00480 354 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 STARD3Q14849 445 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GLYATQ6IB77 296 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KBTBD6Q86V97 674 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 BDH2Q9BUT1 245 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms