RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556083.1

ACTN1-216, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTN1, Length 4,674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-216ENST00000556083 DNAJB4Q9UDY4 337 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 A0A1W2PQH9 124 aa10.64□□□□□ -0.71
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ACTN1-216ENST00000556083 ZNF30P17039 623 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 CDKN2BP42772 138 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 KHKP50053 298 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 IFNL1Q8IU54 200 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 DNAJB14Q8TBM8 379 aa10.64□□□□□ -0.71
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ACTN1-216ENST00000556083 RNF44Q7L0R7 432 aa10.63□□□□□ -0.71
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ACTN1-216ENST00000556083 FFAR3O14843 346 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 GPR42O15529 346 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 CHP2O43745 196 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 FADS2O95864 444 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 DGKGP49619 791 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 SLC7A2P52569 658 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 MAPK12P53778 367 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 SP2Q02086 613 aa10.62□□□□□ -0.71
ACTN1-216ENST00000556083 GSTM4Q03013 218 aa10.62□□□□□ -0.71
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