RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554902.5

PNN-204, Transcript of pinin, desmosome associated protein, human

TSL 2

Gene PNN, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNN-204	ENST00000554902	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CROCCP2	Q86T23	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PALB2	Q86YC2	1186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PDP2	Q9P2J9	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SNX12	Q9UMY4	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CBY3	A6NI87	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PSMA7	O14818	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FAM107A	O95990	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GHR	P10912	638 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GNLY	P22749	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	DCTD	P32321	178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ELF1	P32519	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TTK	P33981	857 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	KRT2	P35908	639 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TDO2	P48775	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FNTA	P49354	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CENPA	P49450	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	BLK	P51451	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	EFNB1	P98172	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	UBXN1	Q04323	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CUL1	Q13616	776 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GPR68	Q15743	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	RNF183	Q96D59	192 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	CACNA1B	Q00975	2339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PNN-204	ENST00000554902	ATRX	P46100	2492 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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