RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 TIPRLO75663 272 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TM7SF2O76062 418 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 KRT75O95678 551 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TRBC1P01850 177 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CAPN1P07384 714 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TCF3P15923 654 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PTGER3P43115 390 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CAP1Q01518 475 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 GPAT3Q53EU6 434 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 OR8H2Q8N162 312 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 KCTD13Q8WZ19 329 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 NPY6RQ99463 290 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 GMPPBQ9Y5P6 360 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 GRIN2DO15399 1336 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SLC6A2P23975 617 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 COPZ1P61923 177 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 INAQ16352 499 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 AAGABQ6PD74 315 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CHSY3Q70JA7 882 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TERB1Q8NA31 727 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ACDQ96AP0 544 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MIOSQ9NXC5 875 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 KLHL3Q9UH77 587 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MYL12BO14950 172 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ZW10O43264 779 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MT-ND1P03886 318 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CCDC159P0C7I6 412 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TALDO1P37837 337 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 DGKGP49619 791 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CHN2P52757 468 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PEX6Q13608 980 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CPTPQ5TA50 214 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TPGS2Q68CL5 300 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MACC1Q6ZN28 852 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SFRP1Q8N474 314 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 LPGAT1Q92604 370 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MPP4Q96JB8 637 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 FIZ1Q96SL8 496 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 URADA6NGE7 173 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 J3KR12 359 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SNAP91O60641 907 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 FAM163BP0C2L3 166 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 UGT1A6P19224 532 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 UGT1A1P22309 533 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 UGT1A4P22310 534 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 UGT1A3P35503 534 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 UGT1A5P35504 534 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ACVRL1P37023 503 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CHIT1Q13231 466 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MAPK11Q15759 364 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 MSANTD2Q6P1R3 559 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 CIB1Q99828 191 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 FETUBQ9UGM5 382 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 ARL5AQ9Y689 179 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.98□□□□□ -0.81
GGA3-201ENST00000537686 SLC31A1O15431 190 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms