RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537529.6

MKS1-204, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-204ENST00000537529 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CROTQ9UKG9 612 aa15.5■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ZBBXA8MT70 800 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 E7ENX8 843 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 NR5A2O00482 541 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CCL16O15467 120 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PEX1O43933 1283 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CLDN7O95471 211 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SRCP12931 536 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 HGFP14210 728 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 IDO1P14902 403 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ACRV1P26436 265 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MS4A2Q01362 244 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CDKN3Q16667 212 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GPR33Q49SQ1 333 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 OGFOD2Q6N063 350 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SNX31Q8N9S9 440 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ZNF382Q96SR6 550 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 IL23AQ9NPF7 189 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 IL26Q9NPH9 171 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CRLS1Q9UJA2 301 aa15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 A0A1B0GTL3 188 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ACOT8O14734 319 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MATN4O95460 622 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 FGF19O95750 216 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GLUD1P00367 558 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 BPIP17213 487 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PEX2P28328 305 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PTPN5P54829 565 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 RPS6KA2Q15349 733 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LPCAT4Q643R3 524 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 C22orf39Q6P5X5 142 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MYO1HQ8N1T3 1032 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PPP2R3CQ969Q6 453 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LMLNQ96KR4 655 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CCT7Q99832 543 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CIPCQ9C0C6 399 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TIMM22Q9Y584 194 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 E2F3O00716 465 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TRIM24O15164 1050 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GRM6O15303 877 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 RAD51BO15315 384 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LINC00271P0C7V0 271 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 GJA8P48165 433 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CHRNA6Q15825 494 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MYLK3Q32MK0 819 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 USP45Q70EL2 814 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LYSMD1Q96S90 227 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.48■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ANGPT2O15123 496 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PRR35P0CG20 571 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 DGKAP23743 735 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 38.6
MKS1-204ENST00000537529 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 XKR7Q5GH72 579 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SPATA24Q86W54 205 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 RIN3Q8TB24 985 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 UCMAQ8WVF2 138 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 LRGUKQ96M69 825 aa15.47■□□□□ 0.07
MKS1-204ENST00000537529 TCF25Q9BQ70 676 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms