RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.67■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 MYO18BQ8IUG5 2567 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 KMOO15229 486 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 UBXN7O94888 489 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CDK14O94921 469 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 C9P02748 559 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TYRP1P17643 537 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PTPN3P26045 913 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 KCNAB2Q13303 367 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 RNF31Q96EP0 1072 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 C9orf72Q96LT7 481 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TEKT5Q96M29 485 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CCDC42Q96M95 316 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CATSPER2Q96P56 530 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PRR19A6NJB7 356 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 CBFA2T2O43439 604 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 VEGFDO43915 354 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 DLGAP3O95886 979 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PRKAR1AP10644 381 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 AMD1P17707 334 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 FOXM1Q08050 763 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 ABHD18Q0P651 414 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 LLGL1Q15334 1064 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TGM7Q96PF1 710 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 VPS35Q96QK1 796 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TIMM29Q9BSF4 260 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 EFHD1Q9BUP0 239 aa16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
HERC3-211ENST00000513325 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 BRAFP15056 766 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 COMTP21964 271 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 IDSP22304 550 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 CD68P34810 354 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 HMGCLP35914 325 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SLC1A1P43005 524 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 NR2C2P49116 596 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SEPHS1P49903 392 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 CDC20Q12834 499 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 NOMO1Q15155 1222 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 VSTM4Q8IW00 320 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TRIM10Q9UDY6 481 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TUBD1Q9UJT1 453 aa16.64■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP6O43182 974 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SPOPO43791 374 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 CST8O60676 142 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 MFAP3LO75121 409 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TPM1P09493 284 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ZNF28P17035 718 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 OAS2P29728 719 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 STAT5AP42229 794 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 CDKN2BP42772 138 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SH3BP2P78314 561 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TLE1Q04724 770 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 WASHC5Q12768 1159 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TFDP2Q14188 446 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 AGAP9Q5VTM2 703 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 C16orf46Q6P387 395 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 KDELC1Q6UW63 502 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 WASH2PQ6VEQ5 465 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ESX1Q8N693 406 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 GDAP1Q8TB36 358 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 STARD8Q92502 1023 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 RSC1A1Q92681 617 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 OR6C1Q96RD1 312 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 WASH6PQ9NQA3 447 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 POT1Q9NUX5 634 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 FAM153AQ9UHL3 310 aa16.63■□□□□ 0.25
HERC3-211ENST00000513325 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms