RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 MC2RQ01718 297 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 NFATC3Q12968 1075 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TBR1Q16650 682 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 KDELC1Q6UW63 502 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 CEACAM20Q6UY09 585 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PLXDC1Q8IUK5 500 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 CTRCQ99895 268 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZPBPQ9BS86 351 aa24.3■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SLC28A2O43868 658 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ADCY2Q08462 1091 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2H3Q13889 308 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 NOMO1Q15155 1222 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM26Q6ZUK4 368 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF547Q8IVP9 402 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 GDAP1Q8TB36 358 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 HAUS1Q96CS2 278 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 VAT1Q99536 393 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 POT1Q9NUX5 634 aa24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 F5H423 210 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD34CP0C6C1 535 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SFTPCP11686 197 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 VCLP18206 1134 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF567Q8N184 647 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TC2NQ8N9U0 490 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 FCRL5Q96RD9 977 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 FAM117AQ9C073 453 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 HACD3Q9P035 362 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PILRAQ9UKJ1 303 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PRR19A6NJB7 356 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 UBXN7O94888 489 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 EPOP01588 193 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SPAM1P38567 509 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SLC19A1P41440 591 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 CHRNA4P43681 627 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 GFERP55789 205 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PID1Q7Z2X4 250 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TTC30BQ8N4P2 665 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A41Q8N5S1 370 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 MRGPRX2Q96LB1 330 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 TTC25Q96NG3 672 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 APMAPQ9HDC9 416 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 OGFRQ9NZT2 677 aa24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ALYREF-203ENST00000511412 HACD1B0YJ81 288 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 C9P02748 559 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 TYRP1P17643 537 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 HLA-DPA1P20036 260 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 IDSP22304 550 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 RPL10P27635 214 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 MARCKSL1P49006 195 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 SLC1A5Q15758 541 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 SARM1Q6SZW1 724 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 IPMKQ8NFU5 416 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 BRSK1Q8TDC3 778 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 C9orf72Q96LT7 481 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 FSD1LQ9BXM9 530 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM5Q9C035 493 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 IL26Q9NPH9 171 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 STARD5Q9NSY2 213 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.26■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 STK17BO94768 372 aa24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 LCA5LO95447 670 aa24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 BRAFP15056 766 aa24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 AMD1P17707 334 aa24.25■■□□□ 1.47
ALYREF-203ENST00000511412 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms