RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ICAM1	P05362	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	RB1	P06400	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CLTB	P09497	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	RXRG	P48443	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CAMP	P49913	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	GPR143	P51810	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CTSC	P53634	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MMP28	Q9H239	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CAPN3	P20807	821 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ANOS1	P23352	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	AHR	P35869	848 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MSH2	P43246	934 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	COG7	P83436	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SETD4	Q9NVD3	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZBTB43	O43298	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CBWD5-231	ENST00000495615	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM72C	H0Y354	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	P2RY10	O00398	339 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	SYNGR3	O43761	229 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	PDE9A	O76083	593 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	KCNK5	O95279	499 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	ACADL	P28330	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	PSMB10	P40306	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	MEP1A	Q16819	746 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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