RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TMTC2	Q8N394	836 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PHF21A	Q96BD5	680 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	LINGO1	Q96FE5	620 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF583	Q96ND8	569 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZFP57	Q9NU63	452 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZBED4	O75132	1171 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PTP4A3	O75365	173 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CLTB	P09497	229 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	NR2F2	P24468	414 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	AHR	P35869	848 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	MSH2	P43246	934 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GAGE5	Q13069	117 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GAGE6	Q13070	117 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	USP43	Q70EL4	1123 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CHST9	Q7L1S5	443 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	OR52I2	Q8NH67	350 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TIGD1	Q96MW7	591 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	OGFR	Q9NZT2	677 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CTAGE9	A4FU28	777 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	AP3D1	O14617	1153 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	LINC01565	O15544	149 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PLPP2	O43688	288 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TMCC2	O75069	709 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RB1	P06400	928 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CTAGE8	P0CG41	777 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GABRB1	P18505	474 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CTSC	P53634	463 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188		Q75L30	129 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TTC39C	Q8N584	583 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GAD1	Q99259	594 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	FBXL17	Q9UF56	701 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SYNGR3	O43761	229 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ANOS1	P23352	680 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PON1	P27169	355 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	MLLT10	P55197	1068 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ACVR2B	Q13705	512 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		5.48	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	PTGES3L	E9PB15	166 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GRID2	O43424	1007 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TPPP	O94811	219 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	GM2A	P17900	193 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	HRH2	P25021	359 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	HADHA	P40939	763 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM198	Q66K66	360 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	RDM1	Q8NG50	284 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	ABHD8	Q96I13	439 aa		5.47	□□□□□ -1.53
RNF146-208	ENST00000495188	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53

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