RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494737.5

CASP12-210, Transcript of caspase 12 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP12, Length 961 nt, Biotype polymorphic pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12-210ENST00000494737 GLIS1Q8NBF1 620 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 HIPK4Q8NE63 616 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SCYL1Q96KG9 808 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 IFT74Q96LB3 600 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PANK4Q9NVE7 773 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NLGN3Q9NZ94 848 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 LRRC42Q9Y546 428 aa5.06□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CENPEQ02224 2701 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 LRRC72A6NJI9 287 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ZNF233A6NK53 670 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 KPNA7A9QM74 516 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 C10orf142B7Z368 130 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 F8VP50 259 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MID1O15344 667 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SLC16A4O15374 487 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 BIRC5O15392 142 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PEX11AO75192 247 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MED24O75448 989 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FAM155BO75949 473 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TMCC1O94876 653 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 GNA14O95837 355 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CLTAP09496 248 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ALPPL2P10696 532 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CD99P14209 185 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CPA1P15085 419 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ACADSP16219 412 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CPEP16870 476 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ATP6V1C1P21283 382 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CCND1P24385 295 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ANXA13P27216 316 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NPTX2P47972 431 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PGFP49763 221 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CCR5P51681 352 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SEC24CP53992 1094 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CTAG1AP78358 180 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 HPCAP84074 193 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MXRA7P84157 204 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CDC20Q12834 499 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 STILQ15468 1287 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NPY5RQ15761 445 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ADCK5Q3MIX3 580 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 IRGCQ6NXR0 463 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TMEM53Q6P2H8 277 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NEK8Q86SG6 692 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 BLIDQ8IZY5 108 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ZNF610Q8N9Z0 462 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 Q8TCH9 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TBC1D31Q96DN5 1066 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SPATA17Q96L03 361 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ZIM3Q96PE6 472 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 LMF1Q96S06 567 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FOXB1Q99853 325 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CCDC3Q9BQI4 270 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SLC26A6Q9BXS9 759 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FBXO10Q9UK96 956 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MYH11P35749 1972 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 LRRD1A4D1F6 860 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 CTAGE9A4FU28 777 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 GOLGA6L10A6NI86 522 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 A8MUI8 341 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 D6RAR5 112 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 NPC1O15118 1278 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 MDM4O15151 490 aa5.04□□□□□ -1.6
CASP12-210ENST00000494737 KRT86O43790 486 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms