RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 VPS51Q9UID3 782 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 MYOFQ9NZM1 2061 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 H3BSA7 217 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 DENRO43583 198 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 VPS26AO75436 327 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CRCPO75575 148 aa12.74□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CDK4P11802 303 aa12.74□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 C6orf10Q5SRN2 563 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MICAL3Q7RTP6 2002 aa12.74□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 IL17CQ9P0M4 197 aa12.73□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.73□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa12.72□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 GREM1O60565 184 aa12.72□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 OR2T11Q8NH01 316 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 NUDT8Q8WV74 236 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 VPS33AQ96AX1 596 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ASB2Q96Q27 587 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 HBEGFQ99075 208 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 C1orf50Q9BV19 199 aa12.72□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 E5RI56 91 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 OR4F21O95013 312 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ATP6V1B2P21281 511 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 RPL5P46777 297 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
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PRAME-213ENST00000492657 RAB26Q9ULW5 256 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TRIM17Q9Y577 477 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CPQQ9Y646 472 aa12.72□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SYCE1LA8MT33 242 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 FXYD1O00168 92 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 AP1G1O43747 822 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 FZD6O60353 706 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 C8BP07358 591 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 UGT1A6P19224 532 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 UGT1A1P22309 533 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 UGT1A4P22310 534 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SLC5A2P31639 672 aa12.71□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 UGT1A3P35503 534 aa12.71□□□□□ -0.37
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