RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492423.5

COPS7B-222, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, human

TSL 2

Gene COPS7B, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	RAD51B	O15315	384 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	INPP4B	O15327	924 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SGTA	O43765	313 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MTX2	O75431	263 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PCCB	P05166	539 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TEAD1	P28347	426 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	CRABP2	P29373	138 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	IGFALS	P35858	605 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SLC12A2	P55011	1212 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MTAP	Q13126	283 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MACC1	Q6ZN28	852 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TRIM69	Q86WT6	500 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ASB12	Q8WXK4	309 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ZNF358	Q9NW07	568 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		14.72	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TECTA	O75443	2155 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423		A0A087X1B8	175 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	IQCF5	A8MTL0	148 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	STK25	O00506	426 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TM9SF1	O15321	606 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	VPS26A	O75436	327 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ZWINT	O95229	277 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	APBB3	O95704	486 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	SEMA4F	O95754	770 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PYGL	P06737	847 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	GSTA1	P08263	222 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	AKT1	P31749	480 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ETV4	P43268	484 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	INSC	Q1MX18	579 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PNCK	Q6P2M8	343 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	RAPH1	Q70E73	1250 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TRIM74	Q86UV6	250 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	GDAP1	Q8TB36	358 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	CD200R1	Q8TD46	325 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	KCNJ9	Q92806	393 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	CENPT	Q96BT3	561 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	FAM136A	Q96C01	138 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	COX14	Q96I36	57 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	IER2	Q9BTL4	223 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	GPAM	Q9HCL2	828 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	ACOT9	Q9Y305	439 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	PLLP	Q9Y342	182 aa		14.71	□□□□□ -0.05
COPS7B-222	ENST00000492423	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	LRRC72	A6NJI9	287 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423		H3BMM5	538 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423		K7ESF4	209 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	DNAJC6	O75061	913 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	COL6A2	P12110	1019 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	MSH3	P20585	1137 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	CLCN7	P51798	805 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	CDK3	Q00526	305 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	LRRC14	Q15048	493 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	C16orf46	Q6P387	395 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	MGARP	Q8TDB4	240 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		14.7	□□□□□ -0.06
COPS7B-222	ENST00000492423	EDA	Q92838	391 aa		14.7	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms