RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SYNCQ9H7C4 482 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DYRK4Q9NR20 520 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A0G2JNJ9 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM72CH0Y354 149 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FFAR2O15552 330 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN6O43657 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SRGAP2O75044 1071 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GCATO75600 419 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 NEBLO76041 1014 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 JMJD7P0C870 316 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ALPPL2P10696 532 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRNB2P17787 502 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TGM2P21980 687 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MMP8P22894 467 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GKP32189 559 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ACVRL1P37023 503 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RABIFP47224 123 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MEOX1P50221 254 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2HP62256 183 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PTP4A2Q12974 167 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF151Q2KHN1 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ISXQ2M1V0 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MYLK3Q32MK0 819 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM72AQ5TYM5 149 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM72DQ6L9T8 149 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM72BQ86X60 149 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM131BQ86XD5 332 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LSMEM2Q8N112 164 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF843Q8N446 348 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CALN1Q9BXU9 219 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KLC2Q9H0B6 622 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEH1Q9H213 219 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 Q9UFV3 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 OR12D3Q9UGF7 316 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.43□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 MAST4O15021 2626 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C2CD4BA6NLJ0 364 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 LMO7DNF2Z398 122 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 F8VZ95 297 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TOR1BO14657 336 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FPGTO14772 594 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 AQP9O43315 295 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 KDELR3O43731 214 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 USP12O75317 370 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CSO75390 466 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GSRP00390 522 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPN9P43378 593 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SELENOPP49908 381 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DNA2P51530 1060 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HDAC4P56524 1084 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 YPEL5P62699 121 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 FMO1Q01740 532 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC173Q0VFZ6 552 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 SGCGQ13326 291 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 RAPGEF1Q13905 1077 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 TCEA2Q15560 299 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.42□□□□□ -1.38
PRPF40A-210ENST00000489741 HS1BP3Q53T59 392 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms