RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCN5P51795 746 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHB3P54753 998 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERVFC1P60507 584 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRNQ16849 979 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VPS26BQ4G0F5 336 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ISCA2Q86U28 154 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF366Q8N895 744 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAT16Q8N8M0 369 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAB3Q8WWW8 586 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIB3Q96RU7 358 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR21Q99679 349 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MGME1Q9BQP7 344 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTG2Q9H4K7 406 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TIMM22Q9Y584 194 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 V9GYQ6 96 aa15.39■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM149AA5PLN7 773 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACOT8O14734 319 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PER2O15055 1255 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHOBTB1O94844 696 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLPTM1O96005 669 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBP1P09455 135 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYOGP15173 224 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MC4RP32245 332 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD97P48960 835 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGTR2P50052 363 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YBX1P67809 324 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX5Q13190 355 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP4S1Q9Y587 144 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRP72O76094 671 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFEMP2O95967 443 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F11P03951 625 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A1P22309 533 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A4P22310 534 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A3P35503 534 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A5P35504 534 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRIA3P42263 894 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HALP42357 657 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX1BP61266 288 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3BP2P78314 561 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ING5Q8WYH8 240 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSPAN17Q96FV3 270 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT87PA6NCN2 255 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VILLO15195 856 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPP40O75818 363 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCL14O95715 111 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGF1P05230 155 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMP3P54852 163 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NAA20P61599 178 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CREB5Q02930 508 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRB7Q14451 532 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS6KA2Q15349 733 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHDC10Q6PID8 442 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PELI3Q8N2H9 469 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FEM1CQ96JP0 617 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOCQ9BWV1 1114 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q9H521 79 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKTIPQ9H8T0 292 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CERS4Q9HA82 394 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASB1Q9Y576 335 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIP5K1BO14986 540 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AKAP10O43572 662 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRCPO75575 148 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8AP07357 584 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACAP2Q15057 778 aa15.37■□□□□ 0.05
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC50Q53HI1 259 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms