RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483881.1

PKP4-212, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 452 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-212ENST00000483881 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 ZNF711Q9Y462 761 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 C3P01024 1663 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ARHGAP5Q13017 1502 aa3.13□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 A0A0G2JPF8 293 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 B4E171 279 aa3.12□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 FAM157AC9JC47 383 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 E5RJQ4 531 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 L7N2F9 121 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 TP73O15350 636 aa3.12□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 TACC1O75410 805 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 OR5F1O95221 314 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 HSPA4LO95757 839 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 CAVIN2O95810 425 aa3.12□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 THEGLP0DJG4 465 aa3.12□□□□□ -1.91
PKP4-212ENST00000483881 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa3.12□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 TOP1P11387 765 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
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PKP4-212ENST00000483881 RNFT2Q96EX2 444 aa3.12□□□□□ -1.91
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