RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	SCG2	P13521	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MMP9	P14780	707 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GRAP	Q13588	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DCST1	Q5T197	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		Q6ZTK2	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PTER	Q96BW5	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	KXD1	Q9BQD3	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SLIT2	O94813	1529 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MYOM1	P52179	1685 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		A8MXE2	369 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		H0YIN7	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		M0QZ24	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	LDB2	O43679	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TBX10	O75333	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC175	P0C221	793 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PIGA	P37287	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RAD23A	P54725	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMF1	P82094	1093 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ROR1	Q01973	937 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CXCL9	Q07325	125 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	FOXM1	Q08050	763 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ALCAM	Q13740	583 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PIM3	Q86V86	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TTC14	Q96N46	770 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		H0YGN5	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	HS3ST1	O14792	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CLGN	O14967	610 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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