RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476590.1

CD55-208, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD55, Length 2,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD55-208ENST00000476590 TMED2Q15363 201 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DUSP6Q16828 381 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DGUOKQ16854 277 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 FSCBQ5H9T9 825 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 MANEALQ5VSG8 457 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 RTL4Q6ZR62 310 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 USP45Q70EL2 814 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 RRM2BQ7LG56 351 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DYMQ7RTS9 669 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ZNF786Q8N393 782 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 FBXW8Q8N3Y1 598 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PPM1NQ8N819 430 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TTLL6Q8N841 843 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PLBD2Q8NHP8 589 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DLG3Q92796 817 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SIPA1Q96FS4 1042 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 MAGED4Q96JG8 741 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 C9orf72Q96LT7 481 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CCDC17Q96LX7 622 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 WWP1Q9H0M0 922 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ASB7Q9H672 318 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 BIN3Q9NQY0 253 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CD300AQ9UGN4 299 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TLK1Q9UKI8 766 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 GPR34Q9UPC5 381 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ASB4Q9Y574 426 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CSADQ9Y600 493 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 C4AP0C0L4 1744 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 C4BP0C0L5 1744 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DLG5Q8TDM6 1919 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PIK3C2AO00443 1686 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ATP8B3O60423 1300 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 A0A1B0GVM2 712 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 L7N2F9 121 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 GPR171O14626 319 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ANGPT2O15123 496 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TP73O15350 636 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SLC31A2O15432 143 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 FAM189A1O60320 539 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ULK1O75385 1050 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 RPS6KA4O75676 772 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SLC22A5O76082 557 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PDE9AO76083 593 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 HSPA4LO95757 839 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 IGHV2-70P01814 119 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 TNNC2P02585 160 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 HRGP04196 525 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ASGR1P07306 291 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 SERPINA6P08185 405 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 PFKMP08237 780 aa4.12□□□□□ -1.75
CD55-208ENST00000476590 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms