RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 F2RL1P55085 397 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CNTNAP1P78357 1384 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CUL4AQ13619 759 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGEF6Q15052 776 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 MED22Q15528 200 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 USP41Q3LFD5 358 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WDR81Q562E7 1941 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 C6orf141Q5SZD1 244 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TTI2Q6NXR4 508 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 C10orf71Q711Q0 1435 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 IGSF8Q969P0 613 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WBP1Q96G27 269 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC7Q96M83 1385 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 KIF9Q9HAQ2 790 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 MYO6Q9UM54 1294 aa3.06□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 NOTCH4Q99466 2003 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WNK3Q9BYP7 1800 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 QSER1Q2KHR3 1735 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ABCC6O95255 1503 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 UTYO14607 1347 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 A0A1W2PR77 199 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GLTPD2A6NH11 291 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TSPY2A6NKD2 308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 LRRC53A6NM62 1247 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PTGES3LE9PB15 166 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ITM2AO43736 263 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GLUD1P00367 558 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 DNTTP04053 509 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TSPY3P0CV98 308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TSPY8P0CW00 308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 IRF1P10914 325 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GPTP24298 496 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 NFKBIAP25963 317 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ACADLP28330 430 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TNFRSF8P28908 595 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 SSTR2P30874 369 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 HADHAP40939 763 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GLUD2P49448 558 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CLCN3P51790 818 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 GAS1P54826 345 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TSPY1Q01534 308 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 EGR4Q05215 589 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 LTBQ06643 244 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WTAPQ15007 396 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 LCN10Q6JVE6 187 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 DPPA4Q7L190 304 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ELP5Q8TE02 316 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FAM216AQ8WUB2 273 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 RND1Q92730 232 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 USP6NLQ92738 828 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 LRFN5Q96NI6 719 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 WNT16Q9UBV4 365 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 HAO1Q9UJM8 370 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PADI3Q9ULW8 664 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 CDC14AQ9UNH5 594 aa3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
TRBV1-201ENST00000476502 A0A0C4DFX4 3053 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms