RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-208ENST00000471880 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 LSMEM2Q8N112 164 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ZNF398Q8TD17 642 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FGF11Q92914 225 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 VPS35Q96QK1 796 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 THSD1Q9NS62 852 aa14.61□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 OR2AG2A6NM03 316 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PPM1DO15297 605 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PSMD3O43242 534 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 B4GAT1O43505 415 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PPFIA2O75334 1257 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 CPNE6O95741 557 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GAS8O95995 478 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FGGP02679 453 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GPR89BP0CG08 455 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 HGFP14210 728 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 MPSTP25325 297 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PDX1P52945 283 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 B4GALNT1Q00973 533 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PDE1BQ01064 536 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PISDQ9UG56 409 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 CACNA1GO43497 2377 aa14.6□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PLD2O14939 933 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 F3P13726 295 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ETS1P14921 441 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ITGALP20701 1170 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 IDSP22304 550 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ABCG1P45844 678 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 MAPK10P53779 464 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 TERF1P54274 439 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FNBP1LQ5T0N5 605 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SFRP1Q8N474 314 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 RCBTB1Q8NDN9 531 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 OR10G6Q8NH81 332 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 NAT14Q8WUY8 206 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 LHX6Q9UPM6 363 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.59□□□□□ -0.07
SSR4-208ENST00000471880 A8MU76 341 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 CHUKO15111 745 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 DUX1O43812 170 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 AP2A1O95782 977 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 VIPP01282 170 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 RALBP11234 206 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 ITPKBP27987 946 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 MC4RP32245 332 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 HADHAP40939 763 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 HALP42357 657 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 GPR3P46089 330 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 IYDQ6PHW0 289 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 LINC00523Q86TU6 105 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 NCSTNQ92542 709 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SSR4-208ENST00000471880 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms