RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR3	P46089	330 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	FASLG	P48023	281 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CLCNKA	P51800	687 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CTSC	P53634	463 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	XIAP	P98170	497 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PDE1B	Q01064	536 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SEPT6	Q14141	434 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	POU6F1	Q14863	301 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC89	Q8N998	374 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM74	Q96NL1	305 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SMOX	Q9NWM0	555 aa		28.86	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	AKT1	P31749	480 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	HHEX	Q03014	270 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	NFATC2	Q13469	925 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		28.85	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	OR2AG2	A6NM03	316 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC2A4	P14672	509 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CD1C	P29017	333 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	FDFT1	P37268	417 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	LMAN1	P49257	510 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	DET1	Q7L5Y6	550 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PIM3	Q86V86	326 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	NAT14	Q8WUY8	206 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC38A3	Q99624	504 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	STRADB	Q9C0K7	418 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		28.84	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC78	A2IDD5	438 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089		E7EVH7	732 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	ZW10	O43264	779 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CPNE6	O95741	557 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	MSH3	P20585	1137 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CCKBR	P32239	447 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNJ1	P48048	391 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF19	Q5T6S3	580 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	LINC00523	Q86TU6	105 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	LSMEM2	Q8N112	164 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	FGF11	Q92914	225 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
FBXO18-208	ENST00000470089	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A0G2JNG1	304 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PRR19	A6NJB7	356 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	HGF	P14210	728 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	HADHA	P40939	763 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	KIR2DS5	Q14953	304 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PAK5	Q9P286	719 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		28.82	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	OR5K4	A6NMS3	321 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	MC4R	P32245	332 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	GRIA1	P42261	906 aa		28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
FBXO18-208	ENST00000470089	SEMA5A	Q13591	1074 aa		28.81	■■■□□ 2.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms